Primer informe de Leptospira interrogans en el roedor sigmodontino Scapteromys aquaticus / First report on Leptospira interrogans in the sigmodontine rodent Scapteromys aquaticus / Primeiro relato da presença de Leptospira interrogans em roedores sigmodontíneos Scapteromys aquaticus

RESUMEN La leptospirosis es una enfermedad zoonótica de distribución mundial que puede transmitirse por contacto directo o indirecto con orina o tejidos de animales infectados. En Argentina, la leptospirosis es endémica en la provincia de Santa Fe y presenta brotes epidémicos durante las inundaciones. Sin embargo, se sabe muy poco sobre el papel que cumplen los roedores silvestres en la diseminación de la enfermedad en el país. El objetivo de este estudio fue identificar las especies hospederas de leptospiras patógenas entre los roedores presentes en un asentamiento ribereño de la provincia de Santa Fe. Se realizó un muestreo de roedores durante octubre de 2015. Los riñones de los animales capturados se analizaron por real-time PCR para el gen LipL32 de leptospiras patógenas. En los animales que resultaron positivos, se realizó test de microaglutinación (MAT) y tipificación molecular por amplificación del gen 16S rRNA y dos esquemas de MLST. Se capturaron 37 roedores de las especies Akodon azarae, Cavia aperea, Oligoryzomys flavescens, Rattus rattus y Scapteromys aquaticus. En el análisis por real-time PCR resultó positivo un macho de Scapteromys aquaticus. El suero de este individuo y del resto de los S. aquaticus capturados (n = 18) se analizaron por test de microaglutinación (MAT), y fueron no reactivos para los 10 serovares probados. La amplificación del gen 16S rRNA identificó la especie infectante como Leptospira interrogans, mientras que no se obtuvo amplificación para los dos esquemas de MLST. El hallazgo de este estudio aporta nueva información acerca de presencia de leptospiras patógenas en roedores silvestres, que es relevante para la zona por tratarse de una especie ampliamente distribuida en ambientes pantanosos e inundables de América del Sur.(AU)

ABSTRACT Leptospirosis is a globally distributed zoonosis that can be transmitted through direct or indirect contact with the urine or tissues of infected animals. In Argentina, leptospirosis is endemic in the province of Santa Fe and epidemic outbreaks occur during floods. However, very little is known about the role that wild rodents play in the spread of the disease in Argentina. The objective of this study was to identify the host species of pathogenic Leptospira among rodents in a riverine settlement in the province of Santa Fe. We conducted a trapping session in October 2015. Kidneys of the captured animals were analyzed by real-time PCR for the LipL32 gene of pathogenic Leptospira. Animals that were positive were subjected to microscopic agglutination test (MAT) and molecular typing by amplification of the 16S rRNA gene and two multilocus sequence typing (MLST) schemes. A total of 37 rodents of the species Akodon azarae, Cavia aperea, Oligoryzomys flavescens, Rattus rattus, and Scapteromys aquaticus were captured. Real-time PCR found one male Scapteromys aquaticus that was positive. The serum of this individual and of the rest of the S. aquaticus captured (n = 18) were analyzed by MAT and were non-reactive for the 10 serovars tested. Amplification of the 16S rRNA gene identified the infective species as Leptospira interrogans, while amplification could not be obtained for the two MLST schemes. The findings of this study contribute new information concerning the presence of pathogenic Leptospira in wild rodents, which is relevant in this region because the species is widely distributed in swampy and flood-prone environments of South America.(AU)

RESUMO A leptospirose é uma doença zoonótica de distribuição mundial transmitida pelo contato direto ou indireto com a urina ou os tecidos de animais infectados. Na Argentina, a leptospirose é endêmica na Província de Santa Fé com surtos epidêmicos ocorrendo com as enchentes. Sabe-se pouco sobre o papel dos roedores silvestres na propagação da doença no país. O objetivo deste estudo foi identificar as espécies hospedeiras de leptospiras patogênicas em roedores encontrados em um núcleo de povoamento ribeirinho na Província de Santa Fé. A amostragem dos roedores foi feita no mês de outubro de 2015. Os tecidos dos rins dos animais capturados foram analisados com a técnica de reação em cadeia da polimerase em tempo real (PCR-RT) quanto à presença do gene LipL32 de leptospiras patógenas. Para os animais com resultados positivos, foi realizado o teste de microaglutinação (MAT) e tipagem molecular baseada na amplificação do gene 16S rRNA e dois esquemas de tipagem por sequenciamento de locos múltiplos (MLST). Ao todo, foram capturados 37 roedores das espécies Akodon azarae, Cavia aperea, Oligoryzomys flavescens, Rattus e Scapteromys aquaticus. O ensaio de PCR-RT foi positivo em um roedor macho da espécie Scapteromys aquaticus. Os soros deste animal e dos outros S. aquaticus capturados (n = 18) foram analisados com o MAT e os resultados foram não reagentes para os 10 sorovares testados. A amplificação do gene 16S rRNA permitiu identificar a espécie infetante como sendo Leptospira interrogans e não houve amplificação nos dois esquemas de MLST. O achado deste estudo fornece um novo dado quanto à presença de leptospiras patogênicas em roedores silvestres, importante para esta área por se tratar de uma espécie de ampla distribuição em terras pantanosas e inundáveis da América do Sul.(AU)

Leptospirosis humana en Argentina: un esquema de análisis, 2014 / Human Leptospirosis in Argentina: An Analysis Scheme, 2014

INTRODUCCIÓN: En general, sólo existen estimaciones sobre el número de casos de leptospirosis en las Américas. La fuente más común son los Ministerios de Salud, tanto nacionales como provinciales, que proporcionan datos útiles sobre tendencias de incidencia de la leptospirosis, identificación de brotes y efectos de intervenciones gubernamentales. OBJETIVOS: Conocer la incidencia de casos de leptospirosis detectados por laboratorio durante 2014 en Argentina y generar un esquema de análisis de bases de datos de diferentes organismos nacionales para que sea repetido y difundido anualmente. MÉTODOS: Se analizaron las bases de datos del Sistema de Vigilancia Laboratorial (SIVILA)y del Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER), teniendo en cuenta los casos notificados en 2014, según la fecha de inicio de síntomas. RESULTADOS: La incidencia de casos confirmados de leptospirosis en 2014 fue de 0,32/100 000 habitantes, mayormente detectados en las provincias de Santa Fe, Buenos Aires y Entre Ríos. Los serogrupos circulantes más prevalentes fueron Icterohaemorrhagiae, Sejroe y Canicola. CONCLUSIONES: Se resalta la utilidad de este tipo de estudios, que incentivan la búsqueda de casos, notificación y vigilancia de la leptospirosis, tanto para mejorar el conocimiento de la incidencia de la enfermedad y su distribución como para orientar las acciones hacia los lugares de mayor riesgo del país.

INTRODUCTION: In general, there are only estimates of the number of cases in the Americas. This data is commonly obtained by both national and provincial Ministries of Health which, despite data limitations, provide useful information on leptospirosis incidence trends, outbreak identification and effects of government interventions. OBJECTIVES: To know the incidence of leptospirosis cases detected by laboratory during 2014 in Argentina, and to generate an analysis scheme of databases from different national organisms to be repeated and diffused annually. METHODS: The SIVILA and INER databases were analyzed, taking into account the cases reported in 2014, according to the date of onset of symptoms. RESULTS: The incidence of confirmed leptospirosis cases in 2014 was 0.32/100 000 persons, mostly detected in Santa Fe, Buenos Aires and Entre Ríos provinces. The most prevalent circulating serogroups were Icterohaemorrhagiae, Sejroe and Canicola. CONCLUSIONS: These studies motivate the suspicion, notification and surveillance of leptospirosis and are useful both to improve the knowledge of the incidence of cases and their distribution, as well as to guide actions towards the most risky places in the country.

Evaluación de un panel reducido de cepas de leptospiras para el diagnóstico en humanos por microaglutinación (MAT) / Evaluation of a reduced panel of leptospira strains for microagglutination

Objetivo. Evaluar si el uso del panel de 19 cepas de leptospiras, sugerido por la Sociedad Internacional de Leptospirosis para la microaglutinación (MAT, por sus siglas en inglés), permite mayor confirmación de casos que el de 12 cepas. Material y métodos. Estudio observacional de corte transversal. Se estudiaron 441 muestras de sueros de pacientes de Argentina, derivadas para el diagnóstico de leptospirosis en los periodos de julio de 2009 a diciembre de 2010 y enero a octubre de 2013. Resultados. Se obtuvo el mismo resultado con el panel reducido que con el ampliado. En seis casos resultó presumiblemente infectante algún serovar del panel ampliado, aunque siempre coaglutinando con cepas del reducido. Conclusión. En Argentina, el diagnóstico de leptospirosis por MAT podría continuar realizándose con el panel reducido, lo que reduciría el costo y tiempo de diagnóstico. La información adicional que aportaría el panel ampliado está relacionada con la epidemiología, mediante un mejor conocimiento del serogrupo presumiblemente infectante.

Objective. To evaluate if the use of the 19 Leptospira strains panel suggested by the International Leptospirosis Society of World Health Organization for microagglutination allows confirmation of more cases that the 12 strains panel used in Argentina. Materials and methods. Cross-sectional observational study. We studied 441 serum samples corresponding to Argentinean patients with suspected leptospirosis derived during from July to December, 2009 and from January to October, 2013. Results. The same number of positive samples was obtained using the MAT with the 19 or 12 strains. In six cases a serovar of the expanded collection was presumably infecting, but always coagglutinated with strains of the reduced panel. Conclusion. In Argentina, the diagnosis of leptospirosis by MAT could be made using the reduced 12 strains panel, obtaining the same result in case detection as using the 19 strains panel. Additional information provided by the use of all strains could be the presumably infecting serogroup.

Diseño y aplicación de una nueva herramienta para la evaluación de la Red Nacional de Laboratorios de Leptospirosis / Design and application of a new tool for the evaluation of the national betwork of leptospirosis laboratories

INTRODUCCION: La leptospirosis es unaenfermedad febril aguda, frecuentemente subdiagnosticada ysubnotificada por su diversa presentación clínica, baja sospechay falta de disponibilidad de métodos diagnósticos rápidos, simples y eficientes. El Laboratorio Nacional de Referencia de Leptospirosis (LNRL) del Instituto Nacional de EnfermedadesRespiratorias (INER) ôDr. Emilio Coniö produce antígeno termorresistente (TR) y lo distribuye a los laboratorios de la Red Nacional de Laboratorios de Leptospirosis (RNLL). Luego, éstosrealizan la técnica y envían las muestras positivas al LNRL para la confirmación del diagnóstico y las negativas para control de calidad (CC). Sin embargo, hasta la realización de este estudio noexistía un control de uso de TR y envío de muestras. OBJETIVOS: Diseñar y aplicar una herramienta para evaluar operativamente la RNLL. METODOS: Durante 2012 y 2013 se aplicó una planilla de registro de uso de TR, y se crearon y analizaron indicadores de eficiencia de uso, aplicación y reposición del TR y derivación de muestras. RESULTADOS: Se observó que entre 2012 y 2013 mejoró la participación en el CC y la eficiencia de uso del TR.La derivación de muestras positivas y la solicitud de reposición de TR se mantuvieron similares. CONCLUSIONES: La planilladiseñada permitió obtener información de cantidad y calidad de uso del TR, y calcular indicadores para evaluar su distribución y aplicación. Se observó que el desempeño de los laboratoriosmejoró de un año al otro.

INTRODUCTION: Leptospirosis is an acute febrile disease, often underdiagnosed and underreported because of its diverse clinical presentation, low suspicion, and unavailability of rapid, simple and efficient diagnostic methods. TheNational Leptospirosis Reference Laboratory (LNRL) of the National Institute of Respiratory Diseases ôDr. Emilio Coniö produces thermo-resistant antigen (TR) and distributes it to the National Network of Leptospirosis Laboratories (RNLL). These laboratories perform the screening, send the positivesamples for confirmation and the negative ones for quality control. However, until this study there was no control of TR uses and shipment of samples. OBJECTIVES: To design andimplement a tool to operatively assess the RNLL. METHODS: During the years 2012 and 2013, a registration form for the TR use was applied, also creating and analyzing indicators of use efficiency, application and replacement of TR, and referral of samples. RESULTS: It was noted that in the period2012-2013, the participation in the CC and efficiency of use of TR improved. The derivation of positive samples and request for replacement TR remained similar. CONCLUSIONS: The designed form allowed for the first time to obtain information on the quantity and quality of use of the reagent, to design andcalculate indicators to assess the distribution and application of TR during 2012 and 2013. In general, the performance of decentralized laboratories improved from one year to the next.

Vigilancia intensificada de Leptospirosis en Santa Fe y Entre Ríos (2012-2013) / Leptospirosis Enhanced Surveillance System in Santa Fe and Entre Rios (2012-2013)

La leptospirosis es la zoonosis de mayor prevalencia mundial. Santa Fe y Entre Ríos concentran la mayoría de casos en Argentina. OBJETIVO: Implementar y describir un sistema de vigilancia intensificada de casos de leptospirosis en Santa Fe y Entre Ríos. MÉTODOS: La investigación, desarrollada desde enero de 2012 hasta marzo de 2013, implicó la intervención en sistemas y servicios de salud, así como el fortalecimiento de la red de laboratorios para el diagnóstico específico y aislamiento de leptospiras. La información obtenida a partir de las fichas clínico-epidemiológicas de los casos confirmados fue analizada y presentada mediante medidas de resumen. La vigilancia intensificada se implementó en siete hospitales estratégicos. RESULTADOS: Ingresaron 183 pacientes. Se confirmaron 24 casos (13%): 10 por MAT, 9 por PCR en tiempo real y 5 por ambos métodos. Se obtuvieron 3 aislamientos (sero grupo Canicola). Fallecieron 4 pacientes con hemorragia pulmonar sumada a compromiso renal, hepático y/o plaquetopenia. CONCLUSIONES: La vigilancia intensificada permitió obtener aislamientos humanos, ratificó el valor de la MAT, evidenció la utilidad de PCR en tiempo real para diagnóstico precoz y corroboró la dificultad de obtener segundas muestras. La presentación clínica evidenció una elevada mortalidad global y una alta frecuencia de compromiso respiratorio asociado a disfunciones orgánicas múltiples de aparición precoz...

Leptospirosis is the most prevalent zoonosis worldwide. In Argentina, Santa Fe and Entre Ríos are the provinces where most cases occur. OBJECTIVE:To implement and describe a system of enhanced surveillance of leptospirosis in Santa Fe and Entre Ríos. METHODS: The enhanced surveillance was carried out from January 2012 to March 2013. The study involved the intervention in health services and systems as well as the laboratory network strengthening for specific diagnosis and leptospira isolation. The information collected from clinical epidemiological records of confirmed cases was analyzed and presented through summary measures. The surveillance was implemented in seven strategic hospitals. RESULTS: A total of 183 patients were enrolled, and 24 cases (13%)were confirmed: 10 through MAT, 9 through real time PCR and 5 through both methods. It was possible to obtain 3 isolates (Canicola serogroup). 4 patients died with pulmonary hemorrhage coupled with renal impairment, hepaticand/ or thrombocytopenia. CONCLUSIONS: The enhanced surveillance allowed to obtain human isolates, confirmed the diagnostic value of MAT, showed the utility of real time PCR for early diagnosis and the difficulties to obtain second samples. The clinical presentation revealed a high global mortality and a high frequency of respiratory involvement related to multiple organ dysfunctions from early stages...

Diagnóstico de leptospirosis humana: evaluación de la aglutinación macroscópica en diferentes etapas de la enfermedad

OBJETIVO: Evaluar la aglutinación macroscópica con antígeno termorresistente (TR) como tamiz diagnóstico de leptospirosis humana en diferentes etapas de la enfermedad. MATERIAL Y MÉTODOS:La definición de casos se basó en la microaglutinación (MAT), recuento de leucocitos y neutrofilia. Se incluyeron 218 casos confirmados y 242 no casos. Cada muestra del banco de sueros del laboratorio del Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias de Santa Fe, Argentina, de 2008 a 2010, se clasificó según días de evolución en tres etapas: primera (<10 días), segunda (10- 25 días) y tercera (>25 días). RESULTADOS: La sensibilidad hallada fue: 71.1, 93.4 y 95.6% para etapas 1, 2 y 3 respectivamente. La especificidad varió de 79.0 a 69.2%. La variabilidad intra e interoperador fue moderada. CONCLUSIÓN: La variabilidad del TR, su baja sensibilidad en la primera etapa y baja especificidad en todas las etapas de la enfermedad sugieren que sería indispensable la incorporación de nuevos métodos diagnósticos de tamiz para la detección precoz de casos en nuestro país, y países donde aún se apliquen este tipo de métodos.

OBJECTIVE: To evaluate the macroscopic agglutination test using Temperature Resistant (TR) antigen as a screening test for the diagnosis of human leptospirosis in different stages of the disease. MATERIALS AND METHODS: The criteria for case definition were based on the results of the microscopic agglutination test (MAT), leukocyte counts and neutrophilia, resulting 218 confirmed cases and 242 non- cases. Each sample was classified according to the days of the disease progression in three stages: first (<10 days), second (10 - 25 days) and third (> 25 days). The design was cross-sectional observational. RESULTS: TR sensitivity was 71,1% on stage 1. 93.4% on stage 2 and 95.6% on stage 3. The specificity at different stages ranged from 79.0 to 69.2%. Intra and inter-operator variability was moderate. CONCLUSION: TR variability, low sensitivity in the first stage and low specificity found in all stages of the disease, suggest that it is essential to incorporate new diagnostic methods to screen for early detection of cases in our country and in countries that still apply such methods.

Evaluation of rapid alternative methods for drug susceptibility testing in clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis

A study was carried out to compare the performance of a commercial method (MGIT) and four inexpensive drug susceptibility methods: nitrate reductase assay (NRA), microscopic observation drug susceptibility (MODS) assay, MTT test, and broth microdilution method (BMM). A total of 64 clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis were studied. The Lowenstein-Jensen proportion method (PM) was used as gold standard. MGIT, NRA, MODS, and MTT results were available on an average of less than 10 days, whereas BMM results could be reported in about 20 days. Most of the evaluated tests showed excellent performance for isoniazid and rifampicin, with sensitivity and specificity values > 90 percent. With most of the assays, sensitivity for ethambutol was low (62-87 percent) whereas for streptomycin, sensitivity values ranged from 84 to 100 percent; NRA-discrepancies were associated with cultures with a low proportion of EMB-resistant organisms while most discrepancies with quantitative tests (MMT and BMM) were seen with isolates whose minimal inhibitory concentrations fell close the cutoff. MGIT is reliable but still expensive. NRA is the most inexpensive and easiest method to perform without changing the organization of the routine PM laboratory performance. While MODS, MTT, and BMM, have the disadvantage from the point of view of biosafety, they offer the possibility of detecting partial resistant strains. This study shows a very good level of agreement of the four low-cost methods compared to the PM for rapid detection of isoniazid, rifampicin and streptomycin resistance (Kappa values > 0.8); more standardization is needed for ethambutol.